Symptomer på bubonisk pest vises vanligvis 2 til 5 dager etter eksponering for bakteriene, men kan oppstå fra noen timer til 12 dager senere. De begynner abrupt med kulderystelser og feber opp til 41 ° C. Heartbeats blir rask og svak og blodtrykket kan falle. Anusen opptrer samtidig eller kort tid etter feberen og er vanligvis smertefull for palpasjonen.
Pesten forårsaket av Yersinia pestis infeksjon kan være bubonic, pneumonisk, septikemisk eller mindre pestis, og symptomene varierer i henhold til type pest. Det kan være rastløshet, delirium, mental forvirring og tap av motorisk koordinering. Lever og milt kan øke i volum.
Mer enn halvparten av de ubehandlede individer dør mellom den tredje og femte dagen etter symptomstart.